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全基因組de novo測序也叫從頭測序,是指不需要任何參考序列,用生物信息學分析方法將測得到的序列進行組裝,從而獲得該物種的全基因組序列圖譜,為后續的基因挖掘、功能驗證提供序列信息;為分子育種和合成生物學研究奠定基礎。
使用Nanopore長序列(N50 達到30Kb,最長序列4Mb以上)組裝后使用二代數據進行糾錯,得到高質量的Contig(N50大于1Mb,部分可到10Mb以上)。結合Hi-C把組裝的Contig掛載到染色體,獲得染色體水平的全基因組序列圖譜,注釋后通過其他分析揭示研究的科學問題。
 

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