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一個物種一個家
基因組數據庫相當于一個物種的官網,關心該物種的科學家可以通過訪問網站了解物種信息、科研進展、下載基因組數據、進行blast等簡單分析。基因組數據庫最核心的模塊是基因組瀏覽器,可以可視化查看基因結構、變異位點、基因表達等信息。
為什么要搭建基因組數據庫
1
方便共享數據
基因組數據庫可以匯集一個物種的所有基因組信息,收集和共享數據;
2
可視化分析
數據
基因組瀏覽器可以對基因組堿基組成、基因結構、SNP等變異信息、基因表達量等進行可視化的生動展示
3
提威望
提高您在該領域的知名度和權威性
4
發文章
提高您在該領基因組數據庫數據積累起來之后可以獨立發文章域的知名度和權威性
標準基因組數據庫(單個物種)
幾乎所有已測序國外機構測序的物種都建立了獨立的基因組數據庫,
比如:水稻、擬南芥、果蠅、小鼠、玉米、家蠶、可可等,還有近期發表的獼猴桃、無油樟。
我們推出的標準基因組數據庫包含以下模塊
:
1.物種信息:介紹該物種的進化地位、特性、科研進展等
2.基因組信息:介紹基因組大小、組裝結果、注釋結果、圖譜、共線性分析等
3.FTP服務器:方便下載基因組相關數據
4.可視化Blast服務器:方便從基因組、CDS、蛋白序列中提取關心的序。
5.基因組瀏覽器:基于Gbrowse或Jbrowse的基因組瀏覽器,可視化查看每一條序列的堿基組成、變異信息(支持重測序結果bam、vcf格式)每一條基因的結構、表達豐度(支持轉錄組數據)
同科(屬)、同類物種基因組數據庫
同一個科屬的物種為了比較基因組學研究的方便,也建立了數據庫。比如:薔薇科、柑橘屬。
相關物種為了功能基因組學的研究方便,建立了基因組數據庫。比如:硬木、豆類、作物。
除了為每個物種提供標準數據庫的功能外,多個物種數據庫還可以提供比較基因組的分析。
功能多樣 價格實惠
標準數據庫僅需5萬/個
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